２０世紀以降の絶え間ない自然破壊や生態系破壊、核や生物兵器などを使用した戦争により、地球は汚染や崩壊で荒廃し、大多数の動植物が死滅した。地球史上６度目の大量絶滅である。その過程で人間は空中に都市を建設し、絶滅寸前の動物達を移住させて種の保存を試みた。空中都市で動物達は人工的な遺伝子交配を経て、特殊な生命体として進化し高度な文明を築く一方、荒廃した下界の存在を思う者は居なくなっていた。 そんなある日、空中都市の子供達がどこからか紛れ込んできた一粒の植物の種を拾う。彼らは外の世界を覗いてみたいと、まだ見ぬ世界へ冒険に出ることを決意した。ひとたび地上に下りると、決して戻れないということを知らずに……（TVアニメ動画『UTOPA』のwikipedia・公式サイト等参照）